สำนักทะเบียนและประมวลผลมหาวิทยาลัยธนบุรี เปิดดำเนินการเมื่อ พ.ศ. 2541 ตามระเบียบวิทยาลัยเทคโนโลยีธนบุรี ว่าด้วยการแบ่งส่วนงาน พ.ศ. 2541 ข้อ 4.4 ต่อมาวิทยาลัยเทคโนโลยีธนบุรี ได้รับการเปลี่ยนประเภทเป็น มหาวิทยาลัยธนบุรี เมื่อวันที่  16  มกราคม  พ.ศ.  2550  ตามโครงสร้างของมหาวิทยาลัย ฯ ได้กำหนดให้งานของสำนักทะเบียนฯ อยู่ภายใต้การควบคุมดูแลของรองอธิการบดีฝ่ายวิชาการ และมีหัวหน้าสำนักดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการสำนักทะเบียนและประมวลผล โดยกำหนดหน้าที่หลักในการรับผิดชอบการจัดการเรียนการสอนของนักศึกษาระดับปริญญาตรี ตั้งแต่เริ่มรับเข้าศึกษาจนกระทั่งสำเร็จการศึกษา
          สำนักทะเบียนและประมวลผลเป็นหน่วยงานกลางที่ดำเนินงานด้านการสนับสนุนการเรียนการสอน โดยเริ่มตั้งแต่การรับเข้าศึกษา การจัดการศึกษาและตรวจสอบการสำเร็จการศึกษาของนักศึกษาให้เป็นไปอย่างมีระบบและได้มาตรฐาน ทำหน้าที่ประสานงานด้าน ตารางสอน ตารางสอบ จัดการลงทะเบียนกระบวนวิชา บันทึกและประมวลผลการศึกษาของนักศึกษาตลอดจนให้บริการงานด้านทะเบียนการศึกษา และรับรองผลสำเร็จการศึกษา

เป้าหมาย/ขอบข่ายงาน

          1. ให้บริการข้อมูลทางการศึกษาที่ถูกต้อง รวดเร็วและเชื่อถือได้อย่างต่อเนื่อง โดยคำนึงถึงความพึงพอใจของผู้ใช้บริการทุกกลุ่ม
          2. พัฒนาระบบปฏิบัติงานและเทคโนโลยีสารสนเทศ ให้เป็นไปอย่างถูกต้อง รวดเร็วและเป็นธรรม
          3. พัฒนาเครือข่ายความร่วมมือทางการศึกษากับสถาบันการศึกษาอื่นๆ
          4. พัฒนาบุคลากรโดยการส่งเสริมให้เกิดศักยภาพในการปฏิบัติงาน
          5. พัฒนางานประกันคุณภาพการศึกษาภายในหน่วยงาน